金門擁有豐富的海洋資源，鯨豚生態教育館的啟用，不僅說明未來縣府發展
海洋觀光的願景，更是強調生態島涵蓋的格局與願景，館內設置了鯨豚時光
隧道、窺探鯨豚、常見鯨豚與分類、金門鯨豚擱淺事件記實、發現鯨豚食性之
謎及鯨豚多媒體互動區等七項展示主軸，將歷年調查資料彙整與蒐集整合，
其中最特殊的是有「媽祖魚」之稱的中華白海豚骨骼標本，是國內少見將
軟骨組織保留下來的全體標本，另標本尾部特殊的增生組織，更有相當難得
的學術價值。
金門鯨豚生態館內部規劃鯨豚時光隧道及窺探鯨豚等七大主題專區，並展示
近年在金門近海擱淺的中華白海豚及露脊鼠海豚骨骼標本，並播映著由行政院
農委會林務局所提供的國家生態電影節影片—海豚的圈圈，館外則由正義國小
所彩繪的海洋生態彩繪，結合卡通立版，打造出適合學生戶外教學及體驗的
主題空間。
鯨豚館外側有石獅一對，原位料羅三魚王宮廟前，民國65年7月，由當年國軍
小艇二大一中隊所敬獻，相傳該廟為供奉向媽祖祝賀而遭誤食的大魚所建，經由
後續相關資料考據，魚種應為鯨豚等海洋大型魚類，在一般民間信仰中，極為
少見；民國100年廟方為整建工程所需，將石獅贈予金門植物園，為紀念這段歷史，
故將石獅安置於鯨豚教育展示館前，以茲紀念。