生態池週邊的小水塘面積不大，水深約100公分，卻是植物園最重要的水生昆蟲及水生植物復育地，水中有完整的水底生態食物鏈， 除了小魚及蝌蚪外，還曾有鱔魚出沒的紀錄，主要的水生昆蟲包括孑孓、龍蝨、仰泳椿、水螳螂、水蠆、負子蟲及螢火蟲等。
